群馬県の弓ヶ谷で奇妙な隕石が発見された。少年が持ち上げられる軽さのそれは、チルソナイトという特殊合金で宇宙人が作ったものだった。一の谷博士は詳しい情報を知るため弓ヶ谷に向かうが、ダムに巨大な隕石が落下して、中から怪獣が現れてしまう。

動物園が何者かに襲われた。巡回した警官に発見された飼育員は「鳥を見た」と言って亡くなってしまう。同じ頃、万城目たち３人は港に現れた奇妙な帆船を調査する。帆船の中には９９８年前の航海日誌があり、文鳥によく似た鳥が紛れ込んでいた。

土星探査ロケット「サタン１号」が何者かに襲われた。由利子は万城目のヘリに乗って「サタン１号」が墜落した海域を調べる。そこで何故か風船を見つけた。その後、万城目のヘリの燃料がなくなってしまう。一平のミスかと思いきや、ラジエーターに奇妙な生物…

国鉄が最後の超特急「いなづま１号」を披露した。由利子は記者待遇で乗車することに。靴磨きのイタチは相棒のヘチマと組んで「いなづま１号」に乗り込んでしまう。一平もカメラマンの振りをして乗車したが、彼の持つスーツケースが思わぬ事件を引き起こす。